s1pr1_human

NAME

3V2Y

ORGANISM

Human (Homo sapiens)

PROTEIN NAME

s1pr1_human

SOURCE

SWISSPROT

SEQUENCE

Perspective: Wild-type Construct

 
                  
N-term        
M
G
P
T
S
V
P
L
V
K
10
                   
                   
A
H
R
S
S
V
S
D
Y
V
20
                   
                   
N
Y
D
I
I
V
R
H
Y
N
30
                   
                   
Y
T
G
K
L
N
I
S
A
D
40
                   
  TM1            
K
E
N
S
I
K
L
T
S
V
50
                   
                   
V
F
I
L
I
C
C
F
I
I
60
                   
                   
L
E
N
I
F
V
L
L
T
I
70
                   
      ICL1 TM2
W
K
T
K
K
F
H
R
P
M
80
                   
                   
Y
Y
F
I
G
N
L
A
L
S
90
                   
                   
D
L
L
A
G
V
A
Y
T
A
100
                   
          ECL1  
N
L
L
L
S
G
A
T
T
Y
110
                   
    TM3          
K
L
T
P
A
Q
W
F
L
R
120
                   
                   
E
G
S
M
F
V
A
L
S
A
130
                   
                   
S
V
F
S
L
L
A
I
A
I
140
                   
                   
E
R
Y
I
T
M
L
K
M
K
150
                   
ICL2   TM4    
L
H
N
G
S
N
N
F
R
L
160
                   
                   
F
L
L
I
S
A
C
W
V
I
170
                   
                   
S
L
I
L
G
G
L
P
I
M
180
                   
  ECL2          
G
W
N
C
I
S
A
L
S
S
190
                   
                   
C
S
T
V
L
P
L
Y
H
K
200
                   
TM5              
H
Y
I
L
F
C
T
T
V
F
210
                   
                   
T
L
L
L
L
S
I
V
I
L
220
                   
                   
Y
C
R
I
Y
S
L
V
R
T
230
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
            ICL3
R
S
R
R
L
T
F
R
K
N
240
 
 
 
 
          
 
        TM6      
I
S
K
A
S
R
S
S
E
K
250
 
 
                
                   
S
L
A
L
L
K
T
V
I
I
260
                   
                   
V
L
S
V
F
I
A
C
W
A
270
                   
                   
P
L
F
I
L
L
L
L
D
V
280
                   
    ECL3   TM7
G
C
K
V
K
T
C
D
I
L
290
                   
                   
F
R
A
E
Y
F
L
V
L
A
300
                   
                   
V
L
N
S
G
T
N
P
I
I
310
                   
        H8        
Y
T
L
T
N
K
E
M
R
R
320
           
 
 
 
 
                   
A
F
I
R
I
M
S
C
C
K
330
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
C-term        
C
P
S
G
D
S
A
G
K
F
340
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
K
R
P
I
I
A
G
M
E
F
350
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
S
R
S
K
S
D
N
S
S
H
360
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
P
Q
K
D
E
G
D
N
P
E
370
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
T
I
M
S
S
G
N
V
N
S
380
 
 
   
S
S
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
hemagglutin
 
                  
  N-term      
 
G
P
T
S
V
P
L
V
K
10
                   
                   
A
H
R
S
S
V
S
D
Y
V
20
                   
                   
N
Y
D
I
I
V
R
H
Y
N
30
                   
                   
Y
T
G
K
L
N
I
S
A
D
40
                   
  TM1            
K
E
N
S
I
K
L
T
S
V
50
                   
                   
V
F
I
L
I
C
C
F
I
I
60
                   
                   
L
E
N
I
F
V
L
L
T
I
70
                   
      ICL1 TM2
W
K
T
K
K
F
H
R
P
M
80
                   
                   
Y
Y
F
I
G
N
L
A
L
S
90
                   
                   
D
L
L
A
G
V
A
Y
T
A
100
                   
          ECL1  
N
L
L
L
S
G
A
T
T
Y
110
                   
    TM3          
K
L
T
P
A
Q
W
F
L
R
120
                   
                   
E
G
S
M
F
V
A
L
S
A
130
                   
                   
S
V
F
S
L
L
A
I
A
I
140
                   
                   
E
R
Y
I
T
M
L
K
M
K
150
                   
ICL2   TM4    
L
H
N
G
S
N
N
F
R
L
160
                   
                   
F
L
L
I
S
A
C
W
V
I
170
                   
                   
S
L
I
L
G
G
L
P
I
M
180
                   
  ECL2          
G
W
N
C
I
S
A
L
S
S
190
                   
                   
C
S
T
V
L
P
L
Y
H
K
200
                   
TM5              
H
Y
I
L
F
C
T
T
V
F
210
                   
                   
T
L
L
L
L
S
I
V
I
L
220
                   
                   
Y
C
R
I
Y
S
L
V
R
T
230
 
 
   
R
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
T4 Lysozyme
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
          
 
 
ICL3 TM6  
A
S
R
S
S
E
 
N
251
 
                  
                   
V
A
L
L
K
T
V
I
I
V
261
                   
                   
L
S
V
F
I
A
C
W
A
P
271
                   
                   
L
F
I
L
L
L
L
D
V
G
281
                   
  ECL3   TM7  
C
K
V
K
T
C
D
I
L
F
291
                   
                   
R
A
E
Y
F
L
V
L
A
V
301
                   
                   
L
N
S
G
T
N
P
I
I
Y
311
                   
      H8          
T
L
T
N
K
E
M
R
R
A
321
         
 
           
F
I
R
I
M
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
His(10)      
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
FLAG            

SCHEMATIC

Perspective: Wild-type Construct

 
 
N-term
 
TM1
 
ICL1
 
TM2
 
ECL1
 
TM3
 
ICL2
 
TM4
 
ECL2
 
 
 
 
TM5
 
 
 
 
 
 
 
 
ICL3
 
 
 
 
TM6
 
ECL3
 
TM7
 
 
H8
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
C-term

 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
hemagg
 
 
 N-term
 
TM1
 
ICL1
 
TM2
 
ECL1
 
TM3
 
ICL2
 
TM4
 
ECL2
 
 
TM5 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
T4 Lys
 
 
ICL3
 
 
 
 
TM6
 
ECL3
 
TM7
 
 
H8 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
His(10
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
FLAG


DIAGRAMS

ICL1 K K F H ICL1ECL1 G A T T Y K L ECL1ICL2 M K L H N G S ICL2ECL2 W N C I S A L S S C S T V L P L Y ECL2ICL3 F R K N I S K A ICL3ECL3 K V K T C ECL3N-term M G P T S V P L V K A H R S S V S D Y V N Y D I I V R H Y N Y T G K L N I S A D K N-termC-term C C K C P S G D S A G K F K R P I I A G M E F S R S K S D N S S H P Q K D E G D N P E T I M S S G N V N S S S C-term E N S I K L T S V V F I L I C C F I I L E N I F V L L T I W K T R P M Y Y F I G N L A L S D L L A G V A Y T A N L L L S T P A Q W F L R E G S M F V A L S A S V F S L L A I A I E R Y I T M L K N N F R L F L L I S A C W V I S L I L G G L P I M G H K H Y I L F C T T V F T L L L L S I V I L Y C R I Y S L V R T R S R R L T S R S S E K S L A L L K T V I I V L S V F I A C W A P L F I L L L L D V G C D I L F R A E Y F L V L A V L N S G T N P I I Y T L T N K E F I R M R R A I M S

MUTATIONS

Position Wild-type Mutated
251 |  S N
252 |  L V

DELETIONS

  • from 1 to 1
  • from 232 to 243
  • from 250 to 250
  • from 327 to 382

    • MODIFICATIONS


    AUXILIARY PROTEINS

    Protein_type: signal

    Name: hemagglutinin
    Sequence: None
    Deletions:
    Positions: N-term_0 None:None
    Presence in Crystal:YES
    Remarks: None

    Protein_type: fusion

    Name: T4 Lysozyme (T4L)
    Sequence: None
    Deletions:
    Positions: Within Receptor_1 232:244
    Presence in Crystal:YES
    Remarks: None

    Protein_type: prot_cleavage

    Name: PreScission site (3C)
    Sequence: None
    Deletions:
    Positions: C-term_2 None:None
    Presence in Crystal:YES
    Remarks: None

    Protein_type: tag

    Name: His(10)
    Sequence: None
    Deletions:
    Positions: C-term_2 None:None
    Presence in Crystal:YES
    Remarks: None

    Protein_type: tag

    Name: FLAG
    Sequence: None
    Deletions:
    Positions: C-term_3 None:None
    Presence in Crystal:YES
    Remarks: None

    EXPRESSION

    Expression method Host cell type Host cell Remarks
    Baculovirus Sf9 Insect

    SOLUBILIZATION

    Solvent type Item Concentration
    additive CHS 0.1 %w/v
    detergent DDM 0.5 %w/v

    Remarks:

    PURIFICATION

    Purification type Description
    Alkylation by Iodoacetamide None

    Remarks:None

    CRYSTALLIZATION

    METHOD: in meso/LCP
    TYPE: lipidic cubic phase (LCP) (monoolein (9.9 MAG))
    PROTEIN CONCENTRATION: 1-100 mg/ml
    Temperature: 20°C
    ph : 7.8-7.8

    Remarks: 96-well glass sandwich plates

    Chemical lists

    Type Item Concentration
    Additional
    unknown Tricine pH 7.75 0.1 M
    unknown PEG 400 34-36 %v/v
    unknown Sodium citrate 80 mM
    unknown Glycerol 4 % v/v
    Detergent
    detergent DDM 0.05 %w/v