ox2r_human

NAME

4S0V

ORGANISM

Human (Homo sapiens)

PROTEIN NAME

ox2r_human

SOURCE

SWISSPROT

SEQUENCE

Perspective: Wild-type Construct

 
 
                
N-term        
M
S
G
T
K
L
E
D
S
P
10
                   
                   
P
C
R
N
W
S
S
A
S
E
20
                   
                   
L
N
E
T
Q
E
P
F
L
N
30
                   
                   
P
T
D
Y
D
D
E
E
F
L
40
                   
                   
R
Y
L
W
R
E
Y
L
H
P
50
                   
    TM1          
K
E
Y
E
W
V
L
I
A
G
60
                   
                   
Y
I
I
V
F
V
V
A
L
I
70
                   
                   
G
N
V
L
V
C
V
A
V
W
80
                   
    ICL1 TM2  
K
N
H
H
M
R
T
V
T
N
90
                   
                   
Y
F
I
V
N
L
S
L
A
D
100
                   
                   
V
L
V
T
I
T
C
L
P
A
110
                   
                   
T
L
V
V
D
I
T
E
T
W
120
                   
ECL1 TM3      
F
F
G
Q
S
L
C
K
V
I
130
                   
                   
P
Y
L
Q
T
V
S
V
S
V
140
                   
                   
S
V
L
T
L
S
C
I
A
L
150
                   
                   
D
R
W
Y
A
I
C
H
P
L
160
                   
ICL2 TM4      
M
F
K
S
T
A
K
R
A
R
170
                   
                   
N
S
I
V
I
I
W
I
V
S
180
                   
                   
C
I
I
M
I
P
Q
A
I
V
190
                   
  ECL2          
M
E
C
S
T
V
F
P
G
L
200
                   
                   
A
N
K
T
T
L
F
T
V
C
210
                   
              TM5
D
E
R
W
G
G
E
I
Y
P
220
                   
                   
K
M
Y
H
I
C
F
F
L
V
230
                   
                   
T
Y
M
A
P
L
C
L
M
V
240
                   
                   
L
A
Y
L
Q
I
F
R
K
L
250
       
 
 
 
 
 
 
            ICL3
W
C
R
Q
I
P
G
T
S
S
260
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
V
V
Q
R
K
W
K
P
L
Q
270
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
P
V
S
Q
P
R
G
P
G
Q
280
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
P
T
K
S
R
M
S
A
V
A
290
 
 
 
              
TM6              
A
E
I
K
Q
I
R
A
R
R
300
             
 
    
                   
K
T
A
R
M
L
M
I
V
L
310
                   
                   
L
V
F
A
I
C
Y
L
P
I
320
                   
                   
S
I
L
N
V
L
K
R
V
F
330
                   
ECL3       TM7
G
M
F
A
H
T
E
D
R
E
340
                   
                   
T
V
Y
A
W
F
T
F
S
H
350
                   
                   
W
L
V
Y
A
N
S
A
A
N
360
                   
              H8  
P
I
I
Y
N
F
L
S
G
K
370
                   
                   
F
R
E
E
F
K
A
A
F
S
380
               
 
 
        C-term
C
C
C
L
G
V
H
H
R
Q
390
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
E
D
R
L
T
R
G
R
T
S
400
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
T
E
S
R
K
S
L
T
T
Q
410
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
I
S
N
F
D
N
I
S
K
L
420
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
S
E
Q
V
V
L
T
S
I
S
430
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
T
L
P
A
A
N
G
A
G
P
440
 
 
 
 
       
L
Q
N
W
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
hemagglutin
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
FLAG            
 
                  
  N-term      
 
G
T
K
L
E
D
S
P
P
11
                   
                   
C
R
N
W
S
S
A
S
E
L
21
                   
                   
N
E
T
Q
E
P
F
L
N
P
31
                   
                   
T
D
Y
D
D
E
E
F
L
R
41
                   
                   
Y
L
W
R
E
Y
L
H
P
K
51
                   
  TM1            
E
Y
E
W
V
L
I
A
G
Y
61
                   
                   
I
I
V
F
V
V
A
L
I
G
71
                   
                   
N
V
L
V
C
V
A
V
W
K
81
                   
  ICL1 TM2    
N
H
H
M
R
T
V
T
N
Y
91
                   
                   
F
I
V
N
L
S
L
A
D
V
101
                   
                   
L
V
T
I
T
C
L
P
A
T
111
                   
                   
L
V
V
D
I
T
E
T
W
F
121
                   
ECL1 TM3      
F
G
Q
S
L
C
K
V
I
P
131
                   
                   
Y
L
Q
T
V
S
V
S
V
S
141
                   
                   
V
L
T
L
S
C
I
A
L
D
151
                   
                   
R
W
Y
A
I
C
H
P
L
M
161
                   
ICL2 TM4      
F
K
S
T
A
K
R
A
R
N
171
                   
                   
S
I
V
I
I
W
I
V
S
C
181
                   
                   
I
I
M
I
P
Q
A
I
V
M
191
                   
ECL2            
E
C
S
T
V
F
P
G
L
A
201
                   
                   
N
K
T
T
L
F
T
V
C
D
211
                   
            TM5  
E
R
W
G
G
E
I
Y
P
K
221
                   
                   
M
Y
H
I
C
F
F
L
V
T
231
                   
                   
Y
M
A
P
L
C
L
M
V
L
241
                   
                   
A
Y
L
Q
I
F
R
K
L
W
251
     
 
       
C
R
Q
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
PGS (Pyroco
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
               
TM6          
K
Q
I
R
A
R
R
K
301
           
 
      
                   
T
A
R
M
L
M
V
V
L
L
311
                   
                   
V
F
A
I
C
Y
L
P
I
S
321
                   
                   
I
L
N
V
L
K
R
V
F
G
331
                   
ECL3     TM7  
M
F
A
H
T
E
D
R
E
T
341
                   
                   
V
Y
A
W
F
T
F
S
H
W
351
                   
                   
L
V
Y
A
N
S
A
A
N
P
361
                   
            H8    
I
I
Y
N
F
L
S
G
K
F
371
                   
                   
R
E
E
F
K
A
A
F
S
C
381
             
 
      C-term
C
C
L
G
V
H
H
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
His(10)      

SCHEMATIC

Perspective: Wild-type Construct

 
 
N-term
 
TM1
 
ICL1
 
TM2
 
ECL1
 
TM3
 
ICL2
 
TM4
 
ECL2
 
 
 
TM5
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
ICL3
 
 
 
 
 
TM6
 
ECL3
 
TM7
 
H8
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
C-term

 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
hemagg
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
FLAG
 
 
 N-term
 
TM1
 
ICL1
 
TM2
 
ECL1
 
TM3
 
ICL2
 
TM4
 
ECL2
 
 
TM5 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
PGS (P
 
 
 
 
TM6
 
ECL3
 
TM7
 
H8
 
 
C-term 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
His(10


DIAGRAMS

ICL1 H H M R ICL1ECL1 T W F F ECL1ICL2 P L M F K S ICL2ECL2 E C S T V F P G L A N K T T L F T V C D E R W G G E ECL2ICL3 G T S S V V Q R K W K P L Q P V S Q P R G P G Q P T K S R M S A ICL3ECL3 G M F A H T E ECL3N-term M S G T K L E D S P P C R N W S S A S E L N E T Q E P F L N P T D Y D D E E F L R Y L W R E Y L H P K E N-termC-term G V H H R Q E D R L T R G R T S T E S R K S L T T Q I S N F D N I S K L S E Q V V L T S I S T L P A A N G A G P L Q N W C-term Y E W V L I A G Y I I V F V V A L I G N V L V C V A V W K N T V T N Y F I V N L S L A D V L V T I T C L P A T L V V D I T E G Q S L C K V I P Y L Q T V S V S V S V L T L S C I A L D R W Y A I C H T A K R A R N S I V I I W I V S C I I M I P Q A I V M I Y P K M Y H I C F F L V T Y M A P L C L M V L A Y L Q I F R K L W C R Q I P V A A E I K Q I R A R R K T A R M L M I V L L V F A I C Y L P I S I L N V L K R V F D R E T V Y A W F T F S H W L V Y A N S A A N P I I Y N F L S G K F K A C C L F R E E A F S C

MUTATIONS

Position Wild-type Mutated
308 |  I V

DELETIONS

  • from 1 to 2
  • from 255 to 293
  • from 389 to 444

    • MODIFICATIONS


    AUXILIARY PROTEINS

    Protein_type: signal

    Name: hemagglutinin
    Sequence: None
    Deletions:
    Positions: N-term_0 None:None
    Presence in Crystal:NO
    Remarks: None

    Protein_type: tag

    Name: FLAG
    Sequence: None
    Deletions:
    Positions: N-term_1 None:None
    Presence in Crystal:YES
    Remarks: None

    Protein_type: fusion

    Name: PGS (Pyrococcus abyssi glycogen synthase)
    Sequence: None
    Deletions:
    Positions: Within Receptor_2 255:293
    Presence in Crystal:YES
    Remarks: None

    Protein_type: tag

    Name: His(10)
    Sequence: None
    Deletions:
    Positions: C-term_3 None:None
    Presence in Crystal:YES
    Remarks: None

    EXPRESSION

    Expression method Host cell type Host cell Remarks
    Baculovirus Sf9 Insect Bac - to - Bac Baculovirus Expression System (Invitrogen)

    SOLUBILIZATION

    Solvent type Item Concentration
    detergent DDM 1.0 %w/v
    additive CHS 0.2 %w/v
    additive sodium cholate 0.2 %w/v

    Remarks:

    PURIFICATION

    Purification type Description
    Alkylation by Iodoacetamide None
    Deglycosylation by PNGase F None
    Detergent DDM exchanged with 0.05% LMNG None

    Remarks:None

    CRYSTALLIZATION

    METHOD: in meso/LCP
    TYPE: lipidic cubic phase (LCP) (monoolein (9.9 MAG))
    PROTEIN CONCENTRATION: 30-35 mg/ml
    Temperature: 20°C
    ph : 5.9-6.0

    Remarks: the protein solution:lipid mass ratio was 2:3

    Chemical lists

    Type Item Concentration
    Additional
    unknown PEG 400 31 % v/v
    unknown Sodium citrate, pH 5.9 100 mM
    unknown Sodium formate 200 mM
    unknown 2,5Hexanediol 3 %w/v
    Detergent
    detergent LMNG 0.05 % w/v