ox1r_human

NAME

4ZJC

ORGANISM

Human (Homo sapiens)

PROTEIN NAME

ox1r_human

SOURCE

SWISSPROT

SEQUENCE

Perspective: Wild-type Construct

                   
N-term        
M
E
P
S
A
T
P
G
A
Q
10
                   
                   
M
G
V
P
P
G
S
R
E
P
20
                   
                   
S
P
V
P
P
D
Y
E
D
E
30
                   
                   
F
L
R
Y
L
W
R
D
Y
L
40
                   
          TM1    
Y
P
K
Q
Y
E
W
V
L
I
50
                   
                   
A
A
Y
V
A
V
F
V
V
A
60
                   
                   
L
V
G
N
T
L
V
C
L
A
70
                   
        ICL1    
V
W
R
N
H
H
M
R
T
V
80
                   
TM2              
T
N
Y
F
I
V
N
L
S
L
90
                   
                   
A
D
V
L
V
T
A
I
C
L
100
                   
                   
P
A
S
L
L
V
D
I
T
E
110
                   
ECL1 TM3      
S
W
L
F
G
H
A
L
C
K
120
                   
                   
V
I
P
Y
L
Q
A
V
S
V
130
                   
                   
S
V
A
V
L
T
L
S
F
I
140
                   
                   
A
L
D
R
W
Y
A
I
C
H
150
                   
ICL2     TM4  
P
L
L
F
K
S
T
A
R
R
160
                   
                   
A
R
G
S
I
L
G
I
W
A
170
                   
                   
V
S
L
A
I
M
V
P
Q
A
180
                   
      ECL2      
A
V
M
E
C
S
S
V
L
P
190
                   
                   
E
L
A
N
R
T
R
L
F
S
200
                   
                   
V
C
D
E
R
W
A
D
D
L
210
                   
TM5              
Y
P
K
I
Y
H
S
C
F
F
220
                   
                   
I
V
T
Y
L
A
P
L
G
L
230
                   
                   
M
A
M
A
Y
F
Q
I
F
R
240
           
 
 
 
 
                   
K
L
W
G
R
Q
I
P
G
T
250
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
ICL3            
T
S
A
L
V
R
N
W
K
R
260
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
P
S
D
Q
L
G
D
L
E
Q
270
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
G
L
S
G
E
P
Q
P
R
A
280
 
 
 
 
 
 
 
      
    TM6          
R
A
F
L
A
E
V
K
Q
M
290
                   
                   
R
A
R
R
K
T
A
K
M
L
300
                   
                   
M
V
V
L
L
V
F
A
L
C
310
               
 
  
                   
Y
L
P
I
S
V
L
N
V
L
320
                   
        ECL3    
K
R
V
F
G
M
F
R
Q
A
330
                   
  TM7            
S
D
R
E
A
V
Y
A
C
F
340
                   
                   
T
F
S
H
W
L
V
Y
A
N
350
                   
                   
S
A
A
N
P
I
I
Y
N
F
360
                   
  H8              
L
S
G
K
F
R
E
Q
F
K
370
                   
                   
A
A
F
S
C
C
L
P
G
L
380
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
C-term        
G
P
C
G
S
L
K
A
P
S
390
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
P
R
S
S
A
S
H
K
S
L
400
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
S
L
Q
S
R
C
S
I
S
K
410
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
I
S
E
H
V
V
L
T
S
V
420
 
 
 
 
 
         
T
T
V
L
P
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
hemagglutin
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
FLAG            
                   
N-term        
M
E
P
S
A
T
P
G
A
Q
10
                   
                   
M
G
V
P
P
G
S
R
E
P
20
                   
                   
S
P
V
P
P
D
Y
E
D
E
30
                   
                   
F
L
R
Y
L
W
R
D
Y
L
40
                   
          TM1    
Y
P
K
Q
Y
E
W
V
L
I
50
                   
                   
A
A
Y
V
A
V
F
V
V
A
60
                   
                   
L
V
G
N
T
L
V
C
L
A
70
                   
        ICL1    
V
W
R
N
H
H
M
R
T
V
80
                   
TM2              
T
N
Y
F
I
V
N
L
S
L
90
                   
                   
A
D
V
L
V
T
A
I
C
L
100
                   
                   
P
A
S
L
L
V
D
I
T
E
110
                   
ECL1 TM3      
S
W
L
F
G
H
A
L
C
K
120
                   
                   
V
I
P
Y
L
Q
A
V
S
V
130
                   
                   
S
V
A
V
L
T
L
S
F
I
140
                   
                   
A
L
D
R
W
Y
A
I
C
H
150
                   
ICL2     TM4  
P
L
L
F
K
S
T
A
R
R
160
                   
                   
A
R
G
S
I
L
G
I
W
A
170
                   
                   
V
S
L
A
I
M
V
P
Q
A
180
                   
      ECL2      
A
V
M
E
C
S
S
V
L
P
190
                   
                   
E
L
A
N
R
T
R
L
F
S
200
                   
                   
V
C
D
E
R
W
A
D
D
L
210
                   
TM5              
Y
P
K
I
Y
H
S
C
F
F
220
                   
                   
I
V
T
Y
L
A
P
L
G
L
230
                   
                   
M
A
M
A
Y
F
Q
I
F
R
240
           
 
             
K
L
W
G
R
Q
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
PGS (Pyroco
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                 
TM6            
K
Q
M
R
A
R
R
K
T
296
                   
                   
A
K
M
L
M
V
V
L
L
V
306
                   
                   
F
A
L
C
Y
L
P
I
S
V
316
   
 
              
                   
L
N
I
L
K
R
V
F
G
M
326
                   
ECL3   TM7    
F
R
Q
A
S
D
R
E
A
V
336
                   
                   
Y
A
C
F
T
F
S
H
W
L
346
                   
                   
V
Y
A
N
S
A
A
N
P
I
356
                   
          H8      
I
Y
N
F
L
S
G
K
F
R
366
                   
                   
E
Q
F
K
A
A
F
S
C
C
376
       
 
    C-term
L
P
G
L
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
His(10)      

SCHEMATIC

Perspective: Wild-type Construct

 
N-term
 
TM1
 
ICL1
 
TM2
 
ECL1
 
TM3
 
ICL2
 
TM4
 
ECL2
 
 
 
TM5
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
ICL3
 
 
 
 
 
TM6
 
ECL3
 
TM7
 
H8
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
C-term

 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
hemagg
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
FLAG
 
N-term
 
TM1
 
ICL1
 
TM2
 
ECL1
 
TM3
 
ICL2
 
TM4
 
ECL2
 
 
TM5 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
PGS (P
 
 
 
 
TM6
 
ECL3
 
TM7
 
H8
 
 
C-term 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
His(10


DIAGRAMS

ICL1 H H M R ICL1ECL1 S W L F ECL1ICL2 P L L F K S ICL2ECL2 E C S S V L P E L A N R T R L F S V C D E R W A D D ECL2ICL3 G T T S A L V R N W K R P S D Q L G D L E Q G L S G E P Q P R A R A ICL3ECL3 G M F R Q A S ECL3N-term M E P S A T P G A Q M G V P P G S R E P S P V P P D Y E D E F L R Y L W R D Y L Y P K Q Y N-termC-term G L G P C G S L K A P S P R S S A S H K S L S L Q S R C S I S K I S E H V V L T S V T T V L P C-term E W V L I A A Y V A V F V V A L V G N T L V C L A V W R N T V T N Y F I V N L S L A D V L V T A I C L P A S L L V D I T E G H A L C K V I P Y L Q A V S V S V A V L T L S F I A L D R W Y A I C H T A R R A R G S I L G I W A V S L A I M V P Q A A V M L Y P K I Y H S C F F I V T Y L A P L G L M A M A Y F Q I F R K L W G R Q I P F L A E V K Q M R A R R K T A K M L M V V L L V F A L C Y L P I S V L N V L K R V F D R E A V Y A C F T F S H W L V Y A N S A A N P I I Y N F L S G K F K A C L P F R E Q A F S C

MUTATIONS

Position Wild-type Mutated
319 |  V I

DELETIONS

  • from 247 to 287
  • from 381 to 425

    • MODIFICATIONS


    AUXILIARY PROTEINS

    Protein_type: signal

    Name: hemagglutinin
    Sequence: None
    Deletions:
    Positions: N-term_0 None:None
    Presence in Crystal:NO
    Remarks: None

    Protein_type: tag

    Name: FLAG
    Sequence: None
    Deletions:
    Positions: N-term_1 None:None
    Presence in Crystal:YES
    Remarks: None

    Protein_type: fusion

    Name: PGS (Pyrococcus abyssi glycogen synthase)
    Sequence: None
    Deletions:
    Positions: Within Receptor_2 247:287
    Presence in Crystal:YES
    Remarks: None

    Protein_type: tag

    Name: His(10)
    Sequence: None
    Deletions:
    Positions: C-term_3 None:None
    Presence in Crystal:YES
    Remarks: None

    EXPRESSION

    Expression method Host cell type Host cell Remarks
    Baculovirus Sf9 Insect pFastBac (Invitrogen)+ Bac-to-Bac

    SOLUBILIZATION

    Solvent type Item Concentration
    detergent DDM 1.0 %w/v
    additive CHS 0.2 %w/v

    Remarks:

    PURIFICATION

    Purification type Description
    Alkylation by Iodoacetamide None
    Deglycosylation by PNGase F None
    Detergent DDM exchanged with 0.05% LMNG None

    Remarks:None

    CRYSTALLIZATION

    METHOD: in meso/LCP
    TYPE: lipidic cubic phase (LCP) (monoolein (9.9 MAG))
    PROTEIN CONCENTRATION: 30 mg/ml
    Temperature: 20°C
    ph : 5.6-5.6

    Remarks: The concentrated receptor samples were reconstituted into a lipid mixture containing monoolein plus 10% (w/w) cholesterol (Sigma), in which the protein solution/lipid mass ratio was 2:3

    Chemical lists

    Type Item Concentration
    Additional
    unknown 1,4-butanediol 4 %
    unknown PEG 400 32 % v/v
    unknown Sodium Citrate pH 5.6 100 mM
    unknown Potassium formate 200 mM
    Detergent
    detergent LMNG 0.05 %w/v