acm1_human

NAME

5CXV

ORGANISM

Human (Homo sapiens)

PROTEIN NAME

acm1_human

SOURCE

SWISSPROT

SEQUENCE

Perspective: Wild-type Construct

 
 
                
N-term        
M
N
T
S
A
P
P
A
V
S
10
 
 
                
                   
P
N
I
T
V
L
A
P
G
K
20
                   
TM1              
G
P
W
Q
V
A
F
I
G
I
30
                   
                   
T
T
G
L
L
S
L
A
T
V
40
                   
                   
T
G
N
L
L
V
L
I
S
F
50
                   
      ICL1 TM2
K
V
N
T
E
L
K
T
V
N
60
                   
                   
N
Y
F
L
L
S
L
A
C
A
70
                   
                   
D
L
I
I
G
T
F
S
M
N
80
                   
                   
L
Y
T
T
Y
L
L
M
G
H
90
                   
ECL1 TM3      
W
A
L
G
T
L
A
C
D
L
100
                 
 
                   
W
L
A
L
D
Y
V
A
S
N
110
                   
                   
A
S
V
M
N
L
L
L
I
S
120
                   
                   
F
D
R
Y
F
S
V
T
R
P
130
                   
ICL2       TM4
L
S
Y
R
A
K
R
T
P
R
140
                   
                   
R
A
A
L
M
I
G
L
A
W
150
                   
                   
L
V
S
F
V
L
W
A
P
A
160
                   
                   
I
L
F
W
Q
Y
L
V
G
E
170
                   
ECL2            
R
T
V
L
A
G
Q
C
Y
I
180
                   
        TM5      
Q
F
L
S
Q
P
I
I
T
F
190
                   
                   
G
T
A
M
A
A
F
Y
L
P
200
                   
                   
V
T
V
M
C
T
L
Y
W
R
210
               
 
 
                   
I
Y
R
E
T
E
N
R
A
R
220
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
          ICL3  
E
L
A
A
L
Q
G
S
E
T
230
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
P
G
K
G
G
G
S
S
S
S
240
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
S
E
R
S
Q
P
G
A
E
G
250
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
S
P
E
T
P
P
G
R
C
C
260
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
R
C
C
R
A
P
R
L
L
Q
270
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
A
Y
S
W
K
E
E
E
E
E
280
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
D
E
G
S
M
E
S
L
T
S
290
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
S
E
G
E
E
P
G
S
E
V
300
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
V
I
K
M
P
M
V
D
P
E
310
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
A
Q
A
P
T
K
Q
P
P
R
320
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
S
S
P
N
T
V
K
R
P
T
330
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
K
K
G
R
D
R
A
G
K
G
340
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
Q
K
P
R
G
K
E
Q
L
A
350
 
 
 
 
            
      TM6        
K
R
K
T
F
S
L
V
K
E
360
                   
                   
K
K
A
A
R
T
L
S
A
I
370
                   
                   
L
L
A
F
I
L
T
W
T
P
380
                   
                   
Y
N
I
M
V
L
V
S
T
F
390
                   
  ECL3 TM7    
C
K
D
C
V
P
E
T
L
W
400
                   
                   
E
L
G
Y
W
L
C
Y
V
N
410
                   
                   
S
T
I
N
P
M
C
Y
A
L
420
                   
  H8              
C
N
K
A
F
R
D
T
F
R
430
                   
                   
L
L
L
L
C
R
W
D
K
R
440
                   
C-term        
R
W
R
K
I
P
K
R
P
G
450
                   
                   
S
V
H
R
T
P
S
R
Q
C
460
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
hemagglutin
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
FLAG            
 
 
                
  N-term      
 
Q
T
S
A
P
P
A
V
S
10
 
 
                
                   
P
Q
I
T
V
L
A
P
G
K
20
                   
TM1              
G
P
W
Q
V
A
F
I
G
I
30
                   
                   
T
T
G
L
L
S
L
A
T
V
40
                   
                   
T
G
N
L
L
V
L
I
S
F
50
                   
      ICL1 TM2
K
V
N
T
E
L
K
T
V
N
60
                   
                   
N
Y
F
L
L
S
L
A
C
A
70
                   
                   
D
L
I
I
G
T
F
S
M
N
80
                   
                   
L
Y
T
T
Y
L
L
M
G
H
90
                   
ECL1 TM3      
W
A
L
G
T
L
A
C
D
L
100
                 
 
                   
W
L
A
L
D
Y
V
A
S
Q
110
                   
                   
A
S
V
M
N
L
L
L
I
S
120
                   
                   
F
D
R
Y
F
S
V
T
R
P
130
                   
ICL2       TM4
L
S
Y
R
A
K
R
T
P
R
140
                   
                   
R
A
A
L
M
I
G
L
A
W
150
                   
                   
L
V
S
F
V
L
W
A
P
A
160
                   
                   
I
L
F
W
Q
Y
L
V
G
E
170
                   
ECL2            
R
T
V
L
A
G
Q
C
Y
I
180
                   
        TM5      
Q
F
L
S
Q
P
I
I
T
F
190
                   
                   
G
T
A
M
A
A
F
Y
L
P
200
                   
                   
V
T
V
M
C
T
L
Y
W
R
210
               
 
                 
I
Y
R
E
T
E
N
R
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
T4 Lysozyme
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
               
TM6          
F
S
L
V
K
E
K
K
362
                   
                   
A
A
R
T
L
S
A
I
L
L
372
                   
                   
A
F
I
L
T
W
T
P
Y
N
382
                   
                   
I
M
V
L
V
S
T
F
C
K
392
                   
ECL3 TM7      
D
C
V
P
E
T
L
W
E
L
402
                   
                   
G
Y
W
L
C
Y
V
N
S
T
412
                   
                   
I
N
P
M
C
Y
A
L
C
N
422
                   
H8                
K
A
F
R
D
T
F
R
L
L
432
                   
      C-term  
L
L
C
R
W
D
K
R
R
W
442
                   
                   
R
K
I
P
K
R
P
G
S
V
452
               
               
H
R
T
P
S
R
Q
C
460
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
His(6)        

SCHEMATIC

Perspective: Wild-type Construct

 
 
 
 
 
N-term
 
TM1
 
ICL1
 
TM2
 
ECL1
 
 
 
TM3
 
ICL2
 
TM4
 
ECL2
 
 
 
 
 
TM5
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
ICL3
 
 
TM6
 
ECL3
 
TM7
 
H8
 
C-term

 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
hemagg
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
FLAG
 
 
 
 
 
 N-term
 
TM1
 
ICL1
 
TM2
 
ECL1
 
 
 
TM3
 
ICL2
 
TM4
 
ECL2
 
 
TM5 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
T4 Lys
 
 
TM6
 
ECL3
 
TM7
 
H8
 
C-term
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
His(6)


DIAGRAMS

ICL1 T E L K ICL1ECL1 H W A L ECL1ICL2 P L S Y R A K R ICL2ECL2 E R T V L A G Q C Y I Q F L S ECL2ICL3 Q G S E T P G K G G G S S S S S E R S Q P G A E G S P E T P P G R C C R C C R A P R L L Q A Y S W K E E E E E D E G S M E S L T S S E G E E P G S E V V I K M P M V D P E A Q A P T K Q P P R S S P N T V K R P T K K G R D R A G K G Q K P R G K E Q L A K R K ICL3ECL3 K D C V ECL3N-term M N T S A P P A V S P N I T V L A P G K N-termC-term R W D K R R W R K I P K R P G S V H R T P S R Q C C-term G P W Q V A F I G I T T G L L S L A T V T G N L L V L I S F K V N T V N N Y F L L S L A C A D L I I G T F S M N L Y T T Y L L M G G T L A C D L W L A L D Y V A S N A S V M N L L L I S F D R Y F S V T R T P R R A A L M I G L A W L V S F V L W A P A I L F W Q Y L V G Q P I I T F G T A M A A F Y L P V T V M C T L Y W R I Y R E T E N R A R E L A A L T F S L V K E K K A A R T L S A I L L A F I L T W T P Y N I M V L V S T F C P E T L W E L G Y W L C Y V N S T I N P M C Y A L C N K A F R L F R D T L L L C

MUTATIONS

Position Wild-type Mutated
2 |  N Q
12 |  N Q
110 |  N Q

DELETIONS

  • from 1 to 1
  • from 219 to 354

    • MODIFICATIONS


    AUXILIARY PROTEINS

    Protein_type: signal

    Name: hemagglutinin
    Sequence: None
    Deletions:
    Positions: N-term_0 None:None
    Presence in Crystal:YES
    Remarks: None

    Protein_type: tag

    Name: FLAG
    Sequence: None
    Deletions:
    Positions: N-term_1 None:None
    Presence in Crystal:YES
    Remarks: None

    Protein_type: fusion

    Name: T4 Lysozyme (T4L)
    Sequence: None
    Deletions:
    Positions: Within Receptor_2 219:354
    Presence in Crystal:YES
    Remarks: None

    Protein_type: tag

    Name: His(6)
    Sequence: None
    Deletions:
    Positions: C-term_3 None:None
    Presence in Crystal:YES
    Remarks: None

    EXPRESSION

    Expression method Host cell type Host cell Remarks
    Baculovirus Sf9 Insect Bac-to-Bac

    SOLUBILIZATION

    Solvent type Item Concentration
    detergent DDM 1.0 %w/v
    additive CHS 0.03 %w/v

    Remarks:

    PURIFICATION

    Purification type Description
    Alkylation by Iodoacetamide None

    Remarks:None

    CRYSTALLIZATION

    METHOD: in meso/LCP
    TYPE: lipidic cubic phase (LCP) (monoolein (9.9 MAG))
    PROTEIN CONCENTRATION: 50 mg/ml
    Temperature: 20°C
    ph : 8.0-8.0

    Remarks: 1:1.5 parts w/w protein:lipid ratio

    Chemical lists

    Type Item Concentration
    Additional
    unknown Sodium acetate 100 mM
    unknown Bis-tris propane pH 8.0 100 mM
    unknown PEG 300 33 % v/v
    Detergent
    detergent LMNG 0.01 % w/v
    Lipid
    lipid CHS 0.001 %w/v