npy1r_human

NAME

5ZBQ

ORGANISM

Human (Homo sapiens)

PROTEIN NAME

npy1r_human

SOURCE

SWISSPROT

SEQUENCE

Perspective: Wild-type Construct

 
                  
N-term        
M
N
S
T
L
F
S
Q
V
E
10
                   
                   
N
H
S
V
H
S
N
F
S
E
20
                   
                   
K
N
A
Q
L
L
A
F
E
N
30
                   
          TM1    
D
D
C
H
L
P
L
A
M
I
40
                   
                   
F
T
L
A
L
A
Y
G
A
V
50
                   
                   
I
I
L
G
V
S
G
N
L
A
60
                   
                   
L
I
I
I
I
L
K
Q
K
E
70
                   
ICL1 TM2      
M
R
N
V
T
N
I
L
I
V
80
                   
                   
N
L
S
F
S
D
L
L
V
A
90
                   
                   
I
M
C
L
P
F
T
F
V
Y
100
                   
        ECL1    
T
L
M
D
H
W
V
F
G
E
110
                   
TM3              
A
M
C
K
L
N
P
F
V
Q
120
               
 
  
                   
C
V
S
I
T
V
S
I
F
S
130
                   
                   
L
V
L
I
A
V
E
R
H
Q
140
                   
        ICL2    
L
I
I
N
P
R
G
W
R
P
150
                   
TM4              
N
N
R
H
A
Y
V
G
I
A
160
                   
                   
V
I
W
V
L
A
V
A
S
S
170
                   
                   
L
P
F
L
I
Y
Q
V
M
T
180
                   
ECL2            
D
E
P
F
Q
N
V
T
L
D
190
                   
                   
A
Y
K
D
K
Y
V
C
F
D
200
                   
      TM5        
Q
F
P
S
D
S
H
R
L
S
210
                   
                   
Y
T
T
L
L
L
V
L
Q
Y
220
                   
                   
F
G
P
L
C
F
I
F
I
C
230
                   
                   
Y
F
K
I
Y
I
R
L
K
R
240
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
            ICL3
R
N
N
M
M
D
K
M
R
D
250
                   
TM6              
N
K
Y
R
S
S
E
T
K
R
260
                   
                   
I
N
I
M
L
L
S
I
V
V
270
                   
                   
A
F
A
V
C
W
L
P
L
T
280
                   
                   
I
F
N
T
V
F
D
W
N
H
290
                   
ECL3 TM7      
Q
I
I
A
T
C
N
H
N
L
300
                   
                   
L
F
L
L
C
H
L
T
A
M
310
                   
                   
I
S
T
C
V
N
P
I
F
Y
320
                   
      H8          
G
F
L
N
K
N
F
Q
R
D
330
                   
                   
L
Q
F
F
F
N
F
C
D
F
340
                   
C-term        
R
S
R
D
D
D
Y
E
T
I
350
               
 
 
                   
A
M
S
T
M
H
T
D
V
S
360
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
K
T
S
L
K
Q
A
S
P
V
370
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
A
F
K
K
I
N
N
N
D
D
380
 
 
 
 
       
N
E
K
I
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
hemagglutin
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
FLAG            
 
                  
  N-term      
 
N
S
T
L
F
S
Q
V
E
10
                   
                   
N
H
S
V
H
S
N
F
S
E
20
                   
                   
K
N
A
Q
L
L
A
F
E
N
30
                   
          TM1    
D
D
C
H
L
P
L
A
M
I
40
                   
                   
F
T
L
A
L
A
Y
G
A
V
50
                   
                   
I
I
L
G
V
S
G
N
L
A
60
                   
                   
L
I
I
I
I
L
K
Q
K
E
70
                   
ICL1 TM2      
M
R
N
V
T
N
I
L
I
V
80
                   
                   
N
L
S
F
S
D
L
L
V
A
90
                   
                   
I
M
C
L
P
F
T
F
V
Y
100
                   
        ECL1    
T
L
M
D
H
W
V
F
G
E
110
                   
TM3              
A
M
C
K
L
N
P
F
V
Q
120
               
 
  
                   
C
V
S
I
T
V
S
I
W
S
130
                   
                   
L
V
L
I
A
V
E
R
H
Q
140
                   
        ICL2    
L
I
I
N
P
R
G
W
R
P
150
                   
TM4              
N
N
R
H
A
Y
V
G
I
A
160
                   
                   
V
I
W
V
L
A
V
A
S
S
170
                   
                   
L
P
F
L
I
Y
Q
V
M
T
180
                   
ECL2            
D
E
P
F
Q
N
V
T
L
D
190
                   
                   
A
Y
K
D
K
Y
V
C
F
D
200
                   
      TM5        
Q
F
P
S
D
S
H
R
L
S
210
                   
                   
Y
T
T
L
L
L
V
L
Q
Y
220
                   
                   
F
G
P
L
C
F
I
F
I
C
230
                   
                   
Y
F
K
I
Y
I
R
L
K
R
240
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
T4 Lysozyme
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                 
R
N
N
M
M
D
K
M
R
249
 
                  
TM6              
D
N
K
Y
R
S
S
E
T
K
259
                   
                   
R
I
N
I
M
L
L
S
I
V
269
                   
                   
V
A
F
A
V
C
W
L
P
L
279
                   
                   
T
I
F
N
T
V
F
D
W
N
289
                   
ECL3   TM7    
H
Q
I
I
A
T
C
N
H
N
299
                   
                   
L
L
F
L
L
C
H
L
T
A
309
                   
                   
M
I
S
T
C
V
N
P
I
F
319
                   
        H8        
Y
G
F
L
N
K
N
F
Q
R
329
                   
                   
D
L
Q
F
F
F
N
F
C
D
339
                   
C-term        
F
R
S
R
D
D
D
Y
E
T
349
                 
 
                   
I
A
M
S
T
M
H
T
D
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
PreScission
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
His(10)      

SCHEMATIC

Perspective: Wild-type Construct

 
 
N-term
 
TM1
 
ICL1
 
TM2
 
ECL1
 
 
 
TM3
 
ICL2
 
TM4
 
ECL2
 
 
 
 
TM5
 
 
 
ICL3
 
 
TM6
 
ECL3
 
TM7
 
H8
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
C-term

 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
hemagg
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
FLAG
 
 
 N-term
 
TM1
 
ICL1
 
TM2
 
ECL1
 
 
 
TM3
 
ICL2
 
TM4
 
ECL2
 
 
 
 
 
TM5
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
T4 Lys
 
 
 
 
 
 
ICL3
 
 
TM6
 
ECL3
 
TM7
 
H8
 
 
C-term 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
PreSci
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
His(10


DIAGRAMS

ICL1 K E M R ICL1ECL1 H W V F ECL1ICL2 P R G W R P ICL2ECL2 V M T D E P F Q N V T L D A Y K D K Y V C F D Q F P ECL2ICL3 K M R ICL3ECL3 H Q I I A ECL3N-term M N S T L F S Q V E N H S V H S N F S E K N A Q L L A F E N D D C H L N-termC-term N F C D F R S R D D D Y E T I A M S T M H T D V S K T S L K Q A S P V A F K K I N N N D D N E K I C-term P L A M I F T L A L A Y G A V I I L G V S G N L A L I I I I L K Q N V T N I L I V N L S F S D L L V A I M C L P F T F V Y T L M D G E A M C K L N P F V Q C V S I T V S I F S L V L I A V E R H Q L I I N N N R H A Y V G I A V I W V L A V A S S L P F L I Y Q S D S H R L S Y T T L L L V L Q Y F G P L C F I F I C Y F K I Y I R L K R R N N M M D D N K Y R S S E T K R I N I M L L S I V V A F A V C W L P L T I F N T V F D W N T C N H N L L F L L C H L T A M I S T C V N P I F Y G F L N K N L Q F F Q R D F F

MUTATIONS

Position Wild-type Mutated
129 |  F W

DELETIONS

  • from 1 to 1
  • from 359 to 384

    • MODIFICATIONS


    AUXILIARY PROTEINS

    Protein_type: signal

    Name: hemagglutinin
    Sequence: None
    Deletions:
    Positions: N-term_0 None:None
    Presence in Crystal:NO
    Remarks: None

    Protein_type: tag

    Name: FLAG
    Sequence: None
    Deletions:
    Positions: N-term_1 None:None
    Presence in Crystal:YES
    Remarks: None

    Protein_type: fusion

    Name: T4 Lysozyme (T4L)
    Sequence: None
    Deletions:
    Positions: Within Receptor_2 241:250
    Presence in Crystal:YES
    Remarks: None

    Protein_type: prot_cleavage

    Name: PreScission site (3C)
    Sequence: None
    Deletions:
    Positions: C-term_3 None:None
    Presence in Crystal:YES
    Remarks: None

    Protein_type: tag

    Name: His(10)
    Sequence: None
    Deletions:
    Positions: C-term_4 None:None
    Presence in Crystal:NO
    Remarks: None

    EXPRESSION

    Expression method Host cell type Host cell Remarks
    Baculovirus Sf9 Insect Bac - to - Bac Baculovirus Expression System (Invitrogen)

    SOLUBILIZATION

    Solvent type Item Concentration
    detergent DDM 1 %w/v
    additive CHS 0.2 %w/v

    Remarks:

    PURIFICATION

    Purification type Description
    Proteolysis by HRV 3C protease None
    Deglycosylation by PNGase F None

    Remarks:None

    CRYSTALLIZATION

    METHOD: in meso/LCP
    TYPE: lipidic cubic phase (LCP) (monoolein (9.9 MAG))
    PROTEIN CONCENTRATION: 20-30 mg/ml
    Temperature: 19–22 °C
    ph : 7.4-8.0

    Remarks: UR-MK299

    Chemical lists

    Type Item Concentration
    Detergent
    DDM 0.05 % w/v
    Lipid
    CHS 0.01 % w/v
    Additional
    HEPES, pH 7.2–7.6, 0.1 M
    PEG 400 20.0 %v/v