grm5_human

NAME

6FFI

ORGANISM

Human (Homo sapiens)

PROTEIN NAME

grm5_human

SOURCE

SWISSPROT

SEQUENCE

Perspective: Wild-type Construct

 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
N-term        
M
V
L
L
L
I
L
S
V
L
10
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
L
L
K
E
D
V
R
G
S
A
20
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
Q
S
S
E
R
R
V
V
A
H
30
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
M
P
G
D
I
I
I
G
A
L
40
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
F
S
V
H
H
Q
P
T
V
D
50
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
K
V
H
E
R
K
C
G
A
V
60
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
R
E
Q
Y
G
I
Q
R
V
E
70
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
A
M
L
H
T
L
E
R
I
N
80
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
S
D
P
T
L
L
P
N
I
T
90
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
L
G
C
E
I
R
D
S
C
W
100
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
H
S
A
V
A
L
E
Q
S
I
110
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
E
F
I
R
D
S
L
I
S
S
120
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
E
E
E
E
G
L
V
R
C
V
130
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
D
G
S
S
S
S
F
R
S
K
140
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
K
P
I
V
G
V
I
G
P
G
150
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
S
S
S
V
A
I
Q
V
Q
N
160
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
L
L
Q
L
F
N
I
P
Q
I
170
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
A
Y
S
A
T
S
M
D
L
S
180
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
D
K
T
L
F
K
Y
F
M
R
190
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
V
V
P
S
D
A
Q
Q
A
R
200
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
A
M
V
D
I
V
K
R
Y
N
210
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
W
T
Y
V
S
A
V
H
T
E
220
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
G
N
Y
G
E
S
G
M
E
A
230
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
F
K
D
M
S
A
K
E
G
I
240
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
C
I
A
H
S
Y
K
I
Y
S
250
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
N
A
G
E
Q
S
F
D
K
L
260
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
L
K
K
L
T
S
H
L
P
K
270
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
A
R
V
V
A
C
F
C
E
G
280
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
M
T
V
R
G
L
L
M
A
M
290
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
R
R
L
G
L
A
G
E
F
L
300
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
L
L
G
S
D
G
W
A
D
R
310
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
Y
D
V
T
D
G
Y
Q
R
E
320
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
A
V
G
G
I
T
I
K
L
Q
330
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
S
P
D
V
K
W
F
D
D
Y
340
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
Y
L
K
L
R
P
E
T
N
H
350
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
R
N
P
W
F
Q
E
F
W
Q
360
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
H
R
F
Q
C
R
L
E
G
F
370
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
P
Q
E
N
S
K
Y
N
K
T
380
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
C
N
S
S
L
T
L
K
T
H
390
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
H
V
Q
D
S
K
M
G
F
V
400
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
I
N
A
I
Y
S
M
A
Y
G
410
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
L
H
N
M
Q
M
S
L
C
P
420
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
G
Y
A
G
L
C
D
A
M
K
430
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
P
I
D
G
R
K
L
L
E
S
440
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
L
M
K
T
N
F
T
G
V
S
450
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
G
D
T
I
L
F
D
E
N
G
460
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
D
S
P
G
R
Y
E
I
M
N
470
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
F
K
E
M
G
K
D
Y
F
D
480
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
Y
I
N
V
G
S
W
D
N
G
490
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
E
L
K
M
D
D
D
E
V
W
500
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
S
K
K
S
N
I
I
R
S
V
510
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
C
S
E
P
C
E
K
G
Q
I
520
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
K
V
I
R
K
G
E
V
S
C
530
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
C
W
T
C
T
P
C
K
E
N
540
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
E
Y
V
F
D
E
Y
T
C
K
550
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
A
C
Q
L
G
S
W
P
T
D
560
 
 
 
 
 
 
 
 
   
                   
D
L
T
G
C
D
L
I
P
V
570
               
 
 
              TM1
Q
Y
L
R
W
G
D
P
E
P
580
                   
                   
I
A
A
V
V
F
A
C
L
G
590
                   
                   
L
L
A
T
L
F
V
T
V
V
600
                   
        ICL1    
F
I
I
Y
R
D
T
P
V
V
610
                   
      TM2        
K
S
S
S
R
E
L
C
Y
I
620
                   
                   
I
L
A
G
I
C
L
G
Y
L
630
                   
            ECL1
C
T
F
C
L
I
A
K
P
K
640
                   
TM3              
Q
I
Y
C
Y
L
Q
R
I
G
650
                   
                   
I
G
L
S
P
A
M
S
Y
S
660
           
 
 
 
 
                   
A
L
V
T
K
T
N
R
I
A
670
       
 
   
 
 
 
      ICL2      
R
I
L
A
G
S
K
K
K
I
680
                   
                   
C
T
K
K
P
R
F
M
S
A
690
                   
TM4              
C
A
Q
L
V
I
A
F
I
L
700
                   
                   
I
C
I
Q
L
G
I
I
V
A
710
                   
          ECL2  
L
F
I
M
E
P
P
D
I
M
720
                   
                   
H
D
Y
P
S
I
R
E
V
Y
730
                   
          TM5    
L
I
C
N
T
T
N
L
G
V
740
 
 
               
                   
V
T
P
L
G
Y
N
G
L
L
750
   
 
             
                   
I
L
S
C
T
F
Y
A
F
K
760
                   
  ICL3          
T
R
N
V
P
A
N
F
N
E
770
                   
TM6              
A
K
Y
I
A
F
T
M
Y
T
780
                   
                   
T
C
I
I
W
L
A
F
V
P
790
                   
          ECL3 TM7
I
Y
F
G
S
N
Y
K
I
I
800
                   
               
T
M
C
F
S
V
S
L
S
A
810
                   
                   
T
V
A
L
G
C
M
F
V
P
820
                   
                H8
K
V
Y
I
I
L
A
K
P
E
830
           
 
 
 
 
                   
R
N
V
R
S
A
F
T
T
S
840
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
C-term        
T
V
V
R
M
H
V
G
D
G
850
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
K
S
S
S
A
A
S
R
S
S
860
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
S
L
V
N
L
W
K
R
R
G
870
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
S
S
G
E
T
L
R
Y
K
D
880
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
R
R
L
A
Q
H
K
S
E
I
890
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
E
C
F
T
P
K
G
S
M
G
900
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
N
G
G
R
A
T
M
S
S
S
910
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
N
G
K
S
V
T
W
A
Q
N
920
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
E
K
S
S
R
G
Q
H
L
W
930
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
Q
R
L
S
I
H
I
N
K
K
940
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
E
N
P
N
Q
T
A
V
I
K
950
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
P
F
P
K
S
T
E
S
R
G
960
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
L
G
A
G
A
G
A
G
G
S
970
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
A
G
G
V
G
A
T
G
G
A
980
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
G
C
A
G
A
G
P
G
G
P
990
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
E
S
P
D
A
G
P
K
A
L
1000
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
Y
D
V
A
E
A
E
E
H
F
1010
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
P
A
P
A
R
P
R
S
P
S
1020
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
P
I
S
T
L
S
H
R
A
G
1030
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
S
A
S
R
T
D
D
D
V
P
1040
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
S
L
H
S
E
P
V
A
R
S
1050
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
S
S
S
Q
G
S
L
M
E
Q
1060
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
I
S
S
V
V
T
R
F
T
A
1070
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
N
I
S
E
L
N
S
M
M
L
1080
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
S
T
A
A
P
S
P
G
V
G
1090
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
A
P
L
C
S
S
Y
L
I
P
1100
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
K
E
I
Q
L
P
T
T
M
T
1110
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
T
F
A
E
I
Q
P
L
P
A
1120
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
I
E
V
T
G
G
A
Q
P
A
1130
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
A
G
A
Q
A
A
G
D
A
A
1140
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
R
E
S
P
A
A
G
P
E
A
1150
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
A
A
A
K
P
D
L
E
E
L
1160
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
V
A
L
T
P
P
S
P
F
R
1170
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
D
S
V
D
S
G
S
T
T
P
1180
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
N
S
P
V
S
E
S
A
L
C
1190
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
I
P
S
S
P
K
Y
D
T
L
1200
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
I
I
R
D
Y
T
Q
S
S
S
1210
 
 
   
S
L
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
GP64 signal
 
                 
  N-term      
 
P
V
Q
Y
L
R
W
G
D
577
 
 
               
TM1              
P
A
P
I
A
A
V
V
F
A
587
                   
                   
C
L
G
L
L
A
T
L
F
V
597
                   
                   
T
V
V
F
I
I
Y
R
D
T
607
                   
ICL1     TM2  
P
V
V
K
S
S
S
R
E
L
617
                   
                   
C
Y
I
I
L
A
G
I
C
L
627
                   
                   
G
Y
L
C
T
F
C
L
I
A
637
                   
ECL1 TM3      
K
P
K
Q
I
Y
C
Y
L
Q
647
                   
                   
R
I
G
I
G
L
S
P
A
M
657
                 
 
                   
S
Y
S
A
L
V
T
K
T
Y
667
 
 
         
 
   
            ICL2
R
A
A
R
I
L
A
M
S
K
677
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
             
                 
K
 
I
C
T
K
K
P
R
686
                   
    TM4          
F
M
S
A
C
A
Q
L
V
I
696
                   
                   
A
F
I
L
I
C
I
Q
L
G
706
                   
                   
I
I
V
A
L
F
I
M
E
P
716
                   
ECL2            
P
D
I
M
H
D
Y
P
S
I
726
                   
                   
R
E
V
Y
L
I
C
N
T
T
736
         
 
       
TM5              
N
L
G
V
V
A
P
L
G
Y
746
           
 
     
                   
N
G
L
L
I
L
A
C
T
F
756
                   
          ICL3  
Y
A
F
K
T
R
N
V
P
A
766
                   
      TM6        
N
F
N
E
A
K
Y
I
A
F
776
                   
                   
T
M
Y
T
T
C
I
I
W
L
786
                   
                   
A
F
V
P
I
Y
F
G
S
N
796
                   
TM7              
Y
K
I
I
T
M
C
F
S
V
806
                   
                   
S
L
S
A
T
V
A
L
G
C
816
                   
                   
M
F
V
P
K
V
Y
I
I
L
826
                   
 
    H8              
A
K
P
E
R
N
V
R
S
A
 
836
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
His(10)      

SCHEMATIC

Perspective: Wild-type Construct

 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
N-term
 
 
TM1
 
ICL1
 
TM2
 
ECL1
 
 
 
 
 
TM3
 
 
 
 
 
 
ICL2
 
TM4
 
ECL2
 
 
 
 
 
TM5
 
ICL3
 
TM6
 
ECL3
 
TM7
 
 
 
 
 
H8
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
C-term

 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
GP64 s
 
 
 N-term
 
 
TM1
 
ICL1
 
TM2
 
ECL1
 
 
 
 
 
TM3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
T4 Lys
 
 
 
 
 
 
 
ICL2
 
TM4
 
ECL2
 
 
 
 
 
TM5
 
ICL3
 
TM6
 
ECL3
 
TM7
 
 
H8 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
His(10


DIAGRAMS

ICL1 T R D P V V K S S ICL1ECL1 A K P ECL1ICL2 A G S K K K I C T K K P R F M ICL2ECL2 P P D I M H D Y P S I R E V Y L I C N T ECL2ICL3 R N V P A N F N ICL3ECL3 N ECL3N-term M V L L L I L S V L L L K E D V R G S A Q S S E R R V V A H M P G D I I I G A L F S V H H Q P T V D K V H E R K C G A V R E Q Y G I Q R V E A M L H T L E R I N S D P T L L P N I T L G C E I R D S C W H S A V A L E Q S I E F I R D S L I S S E E E E G L V R C V D G S S S S F R S K K P I V G V I G P G S S S V A I Q V Q N L L Q L F N I P Q I A Y S A T S M D L S D K T L F K Y F M R V V P S D A Q Q A R A M V D I V K R Y N W T Y V S A V H T E G N Y G E S G M E A F K D M S A K E G I C I A H S Y K I Y S N A G E Q S F D K L L K K L T S H L P K A R V V A C F C E G M T V R G L L M A M R R L G L A G E F L L L G S D G W A D R Y D V T D G Y Q R E A V G G I T I K L Q S P D V K W F D D Y Y L K L R P E T N H R N P W F Q E F W Q H R F Q C R L E G F P Q E N S K Y N K T C N S S L T L K T H H V Q D S K M G F V I N A I Y S M A Y G L H N M Q M S L C P G Y A G L C D A M K P I D G R K L L E S L M K T N F T G V S G D T I L F D E N G D S P G R Y E I M N F K E M G K D Y F D Y I N V G S W D N G E L K M D D D E V W S K K S N I I R S V C S E P C E K G Q I K V I R K G E V S C C W T C T P C K E N E Y V F D E Y T C K A C Q L G S W P T D D L T G C D L I P V Q Y L R W G D N-termC-term T V V R M H V G D G K S S S A A S R S S S L V N L W K R R G S S G E T L R Y K D R R L A Q H K S E I E C F T P K G S M G N G G R A T M S S S N G K S V T W A Q N E K S S R G Q H L W Q R L S I H I N K K E N P N Q T A V I K P F P K S T E S R G L G A G A G A G G S A G G V G A T G G A G C A G A G P G G P E S P D A G P K A L Y D V A E A E E H F P A P A R P R S P S P I S T L S H R A G S A S R T D D D V P S L H S E P V A R S S S S Q G S L M E Q I S S V V T R F T A N I S E L N S M M L S T A A P S P G V G A P L C S S Y L I P K E I Q L P T T M T T F A E I Q P L P A I E V T G G A Q P A A G A Q A A G D A A R E S P A A G P E A A A A K P D L E E L V A L T P P S P F R D S V D S G S T T P N S P V S E S A L C I P S S P K Y D T L I I R D Y T Q S S S S L C-term P E P I A A V V F A C L G L L A T L F V T V V F I I Y S R E L C Y I I L A G I C L G Y L C T F C L I K Q I Y C Y L Q R I G I G L S P A M S Y S A L V T K T N R I A R I L S A C A Q L V I A F I L I C I Q L G I I V A L F I M E T N L G V V T P L G Y N G L L I L S C T F Y A F K T E A K Y I A F T M Y T T C I I W L A F V P I Y F G S Y K I I T M C F S V S L S A T V A L G C M F V P K V Y I I L A K P E R A F T N V R S T S

MUTATIONS

Position Wild-type Mutated
579 |  E A
667 |  N Y
669 |  I A
675 |  G M
742 |  T A
753 |  S A

DELETIONS

  • from 1 to 568
  • from 679 to 679
  • from 837 to 1212

  • MODIFICATIONS


    AUXILIARY PROTEINS

    Protein_type: signal

    Name: GP64 signal
    Sequence: None
    Deletions:
    Positions: N-term_0 None:None
    Presence in Crystal:NO
    Remarks: None

    Protein_type: fusion

    Name: T4 Lysozyme (T4L)
    Sequence: None
    Deletions:
    Positions: Within Receptor_1 678:679
    Presence in Crystal:YES
    Remarks: None

    Protein_type: tag

    Name: His(10)
    Sequence: None
    Deletions:
    Positions: C-term_2 None:None
    Presence in Crystal:YES
    Remarks: None

    EXPRESSION

    Expression method Host cell type Host cell Remarks
    Baculovirus Sf21 Insect

    SOLUBILIZATION

    Solvent type Item Concentration
    detergent DDM 1.5 %w/v

    Remarks:

    PURIFICATION

    Purification type Description
    NONE None

    Remarks:None

    CRYSTALLIZATION

    METHOD: in meso/LCP
    TYPE: lipidic cubic phase (LCP) (monoolein (9.9 MAG))
    PROTEIN CONCENTRATION: 40.0 mg/ml
    Temperature: 20°C
    ph : 5.5-6.8

    Remarks: With M-PEP ligand(NAM)

    Chemical lists

    Type Item Concentration
    Detergent
    DDM 0.03 % w/v
    Additional
    MES pH 5.5–6.8 100.0 mM
    PEG 400 24-34 % v/v
    ammonium phosphate dibasic 100-250 mM