5-HT6 receptor (5ht6r_rat)

FAMILY

Class A (Rhodopsin) Aminergic receptors 5-Hydroxytryptamine receptors 5-HT6 receptor

GENE

Htr6

ORGANISM

Rat (Rattus norvegicus)

ALT. NAMES

5-hydroxytryptamine receptor 6, 5-HT-6, 5-HT6, ST-B17, Serotonin receptor 6

SOURCE

SWISSPROT

SEQUENCE

N-term        
M
V
P
E
P
G
P
V
N
S
10
                   
S
T
P
A
W
G
P
G
P
P
20
          TM1    
P
A
P
G
G
S
G
W
V
A
30
                   
A
A
L
C
V
V
I
V
L
T
40
                   
A
A
A
N
S
L
L
I
V
L
50
        ICL1    
I
C
T
Q
P
A
L
R
N
T
60
TM2              
S
N
F
F
L
V
S
L
F
T
70
                   
S
D
L
M
V
G
L
V
V
M
80
                   
P
P
A
M
L
N
A
L
Y
G
90
ECL1 TM3      
R
W
V
L
A
R
G
L
C
L
100
                   
L
W
T
A
F
D
V
M
C
C
110
                   
S
A
S
I
L
N
L
C
L
I
120
                   
S
L
D
R
Y
L
L
I
L
S
130
ICL2            
P
L
R
Y
K
L
R
M
T
A
140
TM4              
P
R
A
L
A
L
I
L
G
A
150
                   
W
S
L
A
A
L
A
S
F
L
160
          ECL2  
P
L
L
L
G
W
H
E
L
G
170
                   
K
A
R
T
P
A
P
G
Q
C
180
        TM5      
R
L
L
A
S
L
P
F
V
L
190
                   
V
A
S
G
V
T
F
F
L
P
200
                   
S
G
A
I
C
F
T
Y
C
R
210
                   
I
L
L
A
A
R
K
Q
A
V
220
            ICL3
Q
V
A
S
L
T
T
G
T
A
230
                   
G
Q
A
L
E
T
L
Q
V
P
240
                   
R
T
P
R
P
G
M
E
S
A
250
            TM6  
D
S
R
R
L
A
T
K
H
S
260
                   
R
K
A
L
K
A
S
L
T
L
270
                   
G
I
L
L
G
M
F
F
V
T
280
                   
W
L
P
F
F
V
A
N
I
A
290
        ECL3 TM7
Q
A
V
C
D
C
I
S
P
G
300
                 
L
F
D
V
L
T
W
L
G
Y
310
                   
C
N
S
T
M
N
P
I
I
Y
320
      H8          
P
L
F
M
R
D
F
K
R
A
330
                   
L
G
R
F
L
P
C
V
H
C
340
C-term        
P
P
E
H
R
P
A
L
P
P
350
                   
P
P
C
G
P
L
T
A
V
P
360
                   
D
Q
A
S
A
C
S
R
C
C
370
                   
L
C
L
C
R
Q
T
Q
I
Q
380
                   
T
P
L
Q
G
A
P
R
A
C
390
                   
S
S
Q
P
S
F
C
C
L
E
400
                   
R
P
P
G
T
P
R
H
P
P
410
                   
G
P
P
L
W
S
T
S
L
S
420
                   
Q
T
L
W
S
L
R
Y
G
R
430
           
I
H
S
V
P
P

LINKS

DIAGRAMS

ICL1 P A L R ICL1ECL1 R W V L ECL1ICL2 P L R Y K L R M ICL2ECL2 W H E L G K A R T P A P G Q C R L L A ECL2ICL3 T G T A G Q A L E T L Q V P R T P R P G M E S A D S R R L A ICL3ECL3 D C I ECL3N-term M V P E P G P V N S S T P A W G P G P P P A P G G N-termC-term V H C P P E H R P A L P P P P C G P L T A V P D Q A S A C S R C C L C L C R Q T Q I Q T P L Q G A P R A C S S Q P S F C C L E R P P G T P R H P P G P P L W S T S L S Q T L W S L R Y G R I H S V P P C-term S G W V A A A L C V V I V L T A A A N S L L I V L I C T Q N T S N F F L V S L F T S D L M V G L V V M P P A M L N A L Y G A R G L C L L W T A F D V M C C S A S I L N L C L I S L D R Y L L I L S T A P R A L A L I L G A W S L A A L A S F L P L L L G S L P F V L V A S G V T F F L P S G A I C F T Y C R I L L A A R K Q A V Q V A S L T T K H S R K A L K A S L T L G I L L G M F F V T W L P F F V A N I A Q A V C S P G L F D V L T W L G Y C N S T M N P I I Y P L F M R D L G R F K R A F L P C
Pick color:
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 




Invitro Mutant Data: Increased binding/potency: >5-fold, >10-fold; Reduced binding/potency: >5-fold, >10-fold; No/low effect (<5-fold); and N/A

S N A A A T L V I V V C L A A A V W G S 1 V S L F T S D L M V G V L V M P P A M L N 2 L C L N L I S A S C C M V D F A T W L L 3 A L A L I L G A W S L A A L A S F L P L 4 Y T F C I A G S P L F F T V G S A V L V F 5 G I L L G M F F V T W L P F F V A N I A 6 I P N M T S N C Y G L W T L V D F L G 7
Pick color:
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 




Invitro Mutant Data: Increased binding/potency: >5-fold, >10-fold; Reduced binding/potency: >5-fold, >10-fold; No/low effect (<5-fold); and N/A

PHYSIOLOGICAL LIGANDS

5-hydroxytryptamine

STRUCTURE MODELS

No structure models available. Check the Archive on Structure models for earlier releases.

STRUCTURES

No structures available